29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1151 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1151  protein of unknown function DUF1311  100 
 
 		 170 aa  348  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1024  hypothetical protein  96.95 
 
 		 164 aa  327  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0956  protein of unknown function DUF1311  78.66 
 
 		 164 aa  239  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  32.23 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3634  hypothetical protein  39.02 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  38.54 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  37.5 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  34.38 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  35.23 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  35.87 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  30.95 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  32.22 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  25.84 
 
 		 135 aa  51.2  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0554  protein of unknown function DUF1311  26.96 
 
 		 293 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4451  hypothetical protein  30.71 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.710993  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3370  protein of unknown function DUF1311  26.04 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3635  hypothetical protein  28.24 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  29.11 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0299  hypothetical protein  27.19 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.773031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  28.28 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  29.31 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  29.03 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  27.78 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  27.78 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  28.35 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  28.74 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3302  hypothetical protein  28.05 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861345  normal  0.991534 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  29.31 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  30.21 
 
 		 130 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>