44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1232 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  298  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1541  hypothetical protein  46.36 
 
 
153 aa  120  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.226032  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  45.14 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  39.22 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0141  hypothetical protein  46.9 
 
 
187 aa  84  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1748  hypothetical protein  44.16 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2971  hypothetical protein  42.95 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  34.09 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0901  hypothetical protein  33.11 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  40.95 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  33.08 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  46.84 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  32.33 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  32.82 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  33.33 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  34.33 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  32.58 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  34.33 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  33.08 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  30.28 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  27.78 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  29.56 
 
 
185 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  32.22 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  26.53 
 
 
175 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2922  hypothetical protein  40.31 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.389384 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  31.85 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1995  hypothetical protein  26.06 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  27.63 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5495  hypothetical protein  25.74 
 
 
188 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6886  hypothetical protein  25.74 
 
 
188 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  29.63 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  27.81 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.424695 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3315  hypothetical protein  28.15 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.280631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2577  hypothetical protein  24.62 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3418  hypothetical protein  28.45 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5911  hypothetical protein  29.01 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3270  hypothetical protein  34.29 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.660762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  30.34 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1310  hypothetical protein  22.9 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  26.71 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2369  hypothetical protein  27.61 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1345  hypothetical protein  30.83 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.77021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1644  hypothetical protein  30.83 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>