More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1118 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  71.62 
 
 
445 aa  655    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  70.72 
 
 
446 aa  658    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  70.63 
 
 
446 aa  652    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
446 aa  912    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  68.62 
 
 
447 aa  640    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  61.85 
 
 
446 aa  568  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  60.95 
 
 
448 aa  566  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  62.22 
 
 
445 aa  529  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  49.33 
 
 
448 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  49.1 
 
 
449 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 
449 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 
449 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 
449 aa  419  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  44.59 
 
 
446 aa  359  7e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  40.33 
 
 
431 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  35.95 
 
 
431 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  35.95 
 
 
431 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  35.71 
 
 
431 aa  324  3e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1455  adenylosuccinate lyase  38.1 
 
 
453 aa  323  3e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1217  adenylosuccinate lyase  37.98 
 
 
457 aa  319  6e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0739358  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1423  adenylosuccinate lyase  37.71 
 
 
435 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0018  adenylosuccinate lyase  38.74 
 
 
458 aa  315  9e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.146335  decreased coverage  0.000415583 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  38.16 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  39.14 
 
 
431 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  38.26 
 
 
430 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  40.64 
 
 
431 aa  311  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  37.47 
 
 
430 aa  311  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  38.43 
 
 
434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  40.93 
 
 
435 aa  309  6.999999999999999e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  39.1 
 
 
431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  37.71 
 
 
430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  39.1 
 
 
431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  38.05 
 
 
431 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  38.5 
 
 
430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  38.26 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  36.52 
 
 
451 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  38.5 
 
 
431 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  38.05 
 
 
431 aa  300  3e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  39.56 
 
 
431 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  38.86 
 
 
431 aa  300  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  36.13 
 
 
451 aa  300  3e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  37.2 
 
 
431 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  38.01 
 
 
430 aa  300  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  38.8 
 
 
432 aa  299  6e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  36.28 
 
 
451 aa  299  8e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  39.47 
 
 
433 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  36.03 
 
 
430 aa  298  2e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  36.75 
 
 
431 aa  298  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  40.48 
 
 
431 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  35.89 
 
 
430 aa  297  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  38.19 
 
 
431 aa  296  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  38.16 
 
 
437 aa  297  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  36.6 
 
 
432 aa  295  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  40.05 
 
 
435 aa  293  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  36.36 
 
 
432 aa  293  4e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  37.56 
 
 
435 aa  292  7e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  37.96 
 
 
432 aa  292  7e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  37.56 
 
 
435 aa  292  8e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  37.31 
 
 
435 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  37.56 
 
 
435 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  37.56 
 
 
435 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  37.56 
 
 
435 aa  292  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  37.31 
 
 
433 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  37.56 
 
 
435 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  37.31 
 
 
435 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  36.04 
 
 
431 aa  291  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3849  adenylosuccinate lyase  39.4 
 
 
435 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  37.79 
 
 
445 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  38.15 
 
 
431 aa  291  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  37.23 
 
 
430 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16451  adenylosuccinate lyase  36.97 
 
 
431 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.721255  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  37.73 
 
 
436 aa  290  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  35.41 
 
 
432 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16671  adenylosuccinate lyase  37.2 
 
 
431 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  38.57 
 
 
432 aa  289  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  37.06 
 
 
435 aa  289  7e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  35.5 
 
 
431 aa  289  8e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  36.82 
 
 
435 aa  289  9e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  38.85 
 
 
443 aa  288  9e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1558  adenylosuccinate lyase  36.97 
 
 
431 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  37.2 
 
 
431 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  35.03 
 
 
431 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  37.92 
 
 
422 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  36.83 
 
 
431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  34.45 
 
 
433 aa  286  4e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  39.07 
 
 
435 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  38.86 
 
 
442 aa  285  9e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  35.5 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  40.48 
 
 
431 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0391  adenylosuccinate lyase  36.98 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000515092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  38.11 
 
 
435 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  38.4 
 
 
431 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  38.16 
 
 
435 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  38.16 
 
 
435 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  40.11 
 
 
431 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0469  adenylosuccinate lyase  38.95 
 
 
431 aa  282  1e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802188  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  34.27 
 
 
425 aa  282  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  38.56 
 
 
435 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  38.83 
 
 
438 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  36.99 
 
 
431 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>