33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0291 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0291  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  662    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0766  hypothetical protein  29.75 
 
 
440 aa  129  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305198  normal  0.716911 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2548  hypothetical protein  26.68 
 
 
389 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.140695 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3612  hypothetical protein  28.4 
 
 
388 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2512  membrane protein  28.2 
 
 
406 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1381  hypothetical protein  27.59 
 
 
434 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3340  hypothetical protein  26.36 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0388  hypothetical protein  27.75 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1765  hypothetical protein  26.03 
 
 
443 aa  77  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569122  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2437  hypothetical protein  27.27 
 
 
469 aa  70.5  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813144  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1271  hypothetical protein  24.49 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.486206 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0332  hypothetical protein  23.96 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  35 
 
 
114 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  38.32 
 
 
116 aa  59.7  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0464  hypothetical protein  30.65 
 
 
465 aa  59.3  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00621297  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2298  transcriptional regulator, TrmB  41.38 
 
 
118 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00618378 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0768  hypothetical protein  26.44 
 
 
235 aa  57  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0908711  normal  0.765783 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3289  hypothetical protein  40.85 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  37.23 
 
 
117 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1427  hypothetical protein  36.23 
 
 
444 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1918  hypothetical protein  25.17 
 
 
263 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2531  hypothetical protein  32.56 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000779725  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0584  transcriptional regulator, TrmB  32.22 
 
 
355 aa  46.6  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000506573  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0346  transcriptional regulator, TrmB  35 
 
 
313 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5171  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  26.85 
 
 
168 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1819  hypothetical protein  39.06 
 
 
202 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0671776  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1199  hypothetical protein  29.79 
 
 
181 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3002  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  33.33 
 
 
248 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  37.04 
 
 
640 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  29.67 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1236  regulatory protein, MarR  42.19 
 
 
453 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0508  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
453 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.508311  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1389  hypothetical protein  43.33 
 
 
453 aa  42.7  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>