29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2108 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2108  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  740    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  43.81 
 
 		 940 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  44.84 
 
 		 771 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  42.5 
 
 		 747 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1797  hypothetical protein  43.12 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000782574  normal  1 
 
 
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  41.94 
 
 		 1096 aa  159  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  42.79 
 
 		 586 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  47.68 
 
 		 631 aa  155  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  41.85 
 
 		 635 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  48.34 
 
 		 926 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1864  hypothetical protein  47.4 
 
 		 656 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.935351  normal  0.282908 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1644  hypothetical protein  38.07 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0125  hypothetical protein  39.47 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  42.48 
 
 		 861 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  39.88 
 
 		 525 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  36.08 
 
 		 2552 aa  103  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  27.73 
 
 		 656 aa  97.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  33.73 
 
 		 1351 aa  93.6  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  31.46 
 
 		 1021 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2006  hypothetical protein  31.33 
 
 		 435 aa  86.7  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  33.9 
 
 		 1279 aa  60.5  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  24.6 
 
 		 1783 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  29.17 
 
 		 1361 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3064  hypothetical protein  27.27 
 
 		 168 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187552  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0735  hypothetical protein  29.03 
 
 		 586 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  34.02 
 
 		 910 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2097  hypothetical protein  32.05 
 
 		 171 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1258  hypothetical protein  35.21 
 
 		 561 aa  46.2  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2736  hypothetical protein  29.41 
 
 		 198 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000478028  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>