34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3923 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008739  Maqu_3923  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  844    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3332  hypothetical protein  36.55 
 
 
451 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2954  hypothetical protein  36.03 
 
 
451 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0943524  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1179  hypothetical protein  37.53 
 
 
465 aa  220  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0848  hypothetical protein  36.01 
 
 
457 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1620  hypothetical protein  35.52 
 
 
466 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3429  hypothetical protein  37.13 
 
 
464 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.873207 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1251  hypothetical protein  36.67 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189989  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2399  hypothetical protein  37.4 
 
 
468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.926844  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0430  hypothetical protein  36.46 
 
 
466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3027  hypothetical protein  34.96 
 
 
460 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1428  hypothetical protein  33.59 
 
 
455 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4184  hypothetical protein  36.71 
 
 
468 aa  213  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103191  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0489  hypothetical protein  37.87 
 
 
466 aa  213  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0943  hypothetical protein  36.86 
 
 
468 aa  212  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2358  hypothetical protein  35.83 
 
 
464 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000347039  unclonable  0.000000192089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1393  hypothetical protein  36.99 
 
 
465 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2181  hypothetical protein  37.13 
 
 
468 aa  208  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0688  hypothetical protein  36.6 
 
 
467 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.635205  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0652  hypothetical protein  35.73 
 
 
446 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60000  hypothetical protein  33.42 
 
 
460 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.891513  hitchhiker  0.0000000143793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4521  putative integral membrane protein  33.15 
 
 
460 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36360  conserved hypothetical, protein  34.79 
 
 
454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2864  hypothetical protein  36.04 
 
 
470 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0680  hypothetical protein  33.25 
 
 
475 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4163  hypothetical protein  32.78 
 
 
494 aa  183  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1774  hypothetical protein  31.32 
 
 
666 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0983055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0350  hypothetical protein  31.48 
 
 
494 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4073  hypothetical protein  30.86 
 
 
493 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3700  hypothetical protein  31.83 
 
 
468 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.481707  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1020  hypothetical protein  26.99 
 
 
455 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1058  hypothetical protein  26.99 
 
 
455 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2394  hypothetical protein  26.48 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2752  hypothetical protein  27.71 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0961114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>