59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3114 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  100 
 
 
149 aa  312  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  70.47 
 
 
148 aa  231  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1981  nitric-oxide reductase  69.8 
 
 
148 aa  208  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  61.74 
 
 
146 aa  204  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  61.07 
 
 
146 aa  201  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0121  nitric-oxide reductase  58.39 
 
 
146 aa  191  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.281519  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  55.03 
 
 
141 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1850  nitric-oxide reductase  55.33 
 
 
173 aa  177  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  54.67 
 
 
150 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  53.79 
 
 
144 aa  174  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0224  nitric-oxide reductase, small subunit  53.33 
 
 
150 aa  172  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.501338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  51.33 
 
 
150 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  61.07 
 
 
141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  52.67 
 
 
150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  51.33 
 
 
150 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1641  nitric-oxide reductase, small subunit  52.67 
 
 
150 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3183  nitric-oxide reductase subunit C  52.67 
 
 
150 aa  158  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2484  nitric-oxide reductase  50.33 
 
 
150 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1515  nitric-oxide reductase  48.67 
 
 
150 aa  157  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2117  nitric-oxide reductase  47.33 
 
 
150 aa  152  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.916968 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0970  hypothetical protein  43.33 
 
 
147 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1969  nitric-oxide reductase  43.33 
 
 
150 aa  140  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0324  nitric oxide reductase subunit C, cytochrome c  43.33 
 
 
150 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  52 
 
 
142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  42.07 
 
 
277 aa  120  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  37.59 
 
 
272 aa  110  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  38.46 
 
 
290 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  38.46 
 
 
290 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  34.03 
 
 
238 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  31.94 
 
 
238 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  35.21 
 
 
253 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2401  hypothetical protein  34.82 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  27.72 
 
 
133 aa  60.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1983  nitric-oxide reductase subunit NorC  31.09 
 
 
228 aa  57.4  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000092612  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  33.72 
 
 
311 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  35.23 
 
 
355 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  30.91 
 
 
535 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  30 
 
 
535 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  31.4 
 
 
352 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2122  cytochrome c, class I  24.18 
 
 
312 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.959895  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.91 
 
 
487 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.91 
 
 
487 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  27.07 
 
 
864 aa  41.6  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 
330 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.91 
 
 
535 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  26.72 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  30.91 
 
 
535 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  26.23 
 
 
346 aa  41.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.91 
 
 
535 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  28.28 
 
 
330 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 
349 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 
349 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 
349 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 
349 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 
349 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  27.66 
 
 
326 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 
349 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 
349 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1963  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.02 
 
 
299 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>