40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0121 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0121  nitric-oxide reductase  100 
 
 
146 aa  303  5.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.281519  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  59.59 
 
 
141 aa  193  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  58.39 
 
 
149 aa  191  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  61.97 
 
 
144 aa  189  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  68.49 
 
 
141 aa  189  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  59.59 
 
 
146 aa  186  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  59.59 
 
 
146 aa  186  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  57.43 
 
 
148 aa  186  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1850  nitric-oxide reductase  55.33 
 
 
173 aa  171  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  54 
 
 
150 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  54.61 
 
 
150 aa  170  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0224  nitric-oxide reductase, small subunit  54 
 
 
150 aa  169  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.501338  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  53.33 
 
 
150 aa  167  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1515  nitric-oxide reductase  54.67 
 
 
150 aa  166  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  50.67 
 
 
150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3183  nitric-oxide reductase subunit C  52.67 
 
 
150 aa  161  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2484  nitric-oxide reductase  51.33 
 
 
150 aa  161  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1969  nitric-oxide reductase  52 
 
 
150 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0324  nitric oxide reductase subunit C, cytochrome c  52 
 
 
150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  57.82 
 
 
142 aa  160  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0970  hypothetical protein  51.68 
 
 
147 aa  157  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1981  nitric-oxide reductase  54.05 
 
 
148 aa  157  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2117  nitric-oxide reductase  50.33 
 
 
150 aa  155  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.916968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1641  nitric-oxide reductase, small subunit  55.33 
 
 
150 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  40.85 
 
 
277 aa  116  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  39.13 
 
 
272 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  38.21 
 
 
290 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  38.21 
 
 
290 aa  96.3  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  35.66 
 
 
238 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  34.75 
 
 
238 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  34.72 
 
 
253 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2401  hypothetical protein  36.36 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  32.32 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1983  nitric-oxide reductase subunit NorC  32.38 
 
 
228 aa  59.3  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000092612  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  29.29 
 
 
862 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  30.77 
 
 
419 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  30.95 
 
 
354 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3851  cytochrome c, class I  35.56 
 
 
420 aa  40.8  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585006  normal  0.540211 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  29.29 
 
 
330 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  30.43 
 
 
326 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>