36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2401 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2401  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  417  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1983  nitric-oxide reductase subunit NorC  45.21 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000092612  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1850  nitric-oxide reductase  29.48 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  37.74 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  39.29 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  39.42 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  39.42 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  34.82 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  38.78 
 
 		 290 aa  74.7  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  38.78 
 
 		 290 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 253 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1641  nitric-oxide reductase, small subunit  38.24 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  32.17 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0121  nitric-oxide reductase  36.36 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.281519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  33.04 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1981  nitric-oxide reductase  32.73 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  38 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0224  nitric-oxide reductase, small subunit  32.73 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.501338  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3183  nitric-oxide reductase subunit C  35 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2484  nitric-oxide reductase  31.53 
 
 		 150 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  37.72 
 
 		 141 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  34.31 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  33.93 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1969  nitric-oxide reductase  32.35 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0324  nitric oxide reductase subunit C, cytochrome c  32.35 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115359  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0970  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2117  nitric-oxide reductase  33 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  36.61 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  33.87 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  36.63 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  34.82 
 
 		 146 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1515  nitric-oxide reductase  31 
 
 		 150 aa  62  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  33.01 
 
 		 148 aa  62  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  28.71 
 
 		 133 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  31 
 
 		 382 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  31 
 
 		 382 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>