36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3190 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  100 
 
 		 142 aa  298  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  61.27 
 
 		 141 aa  189  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  69.01 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0121  nitric-oxide reductase  57.82 
 
 		 146 aa  178  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.281519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  59.42 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  54.79 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  54.79 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  55.03 
 
 		 148 aa  167  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  52 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2484  nitric-oxide reductase  49.67 
 
 		 150 aa  153  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  48.34 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  47.68 
 
 		 150 aa  150  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1850  nitric-oxide reductase  49.01 
 
 		 173 aa  148  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0224  nitric-oxide reductase, small subunit  47.02 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.501338  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  46.36 
 
 		 150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  46.36 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1515  nitric-oxide reductase  46.36 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2117  nitric-oxide reductase  45.7 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916968 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1969  nitric-oxide reductase  45.7 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1981  nitric-oxide reductase  52.35 
 
 		 148 aa  141  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0324  nitric oxide reductase subunit C, cytochrome c  45.7 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115359  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3183  nitric-oxide reductase subunit C  44.37 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0970  hypothetical protein  43.33 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1641  nitric-oxide reductase, small subunit  46.36 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  34.56 
 
 		 277 aa  105  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  34.31 
 
 		 238 aa  99.4  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  35.04 
 
 		 253 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  36.75 
 
 		 290 aa  97.1  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  36.75 
 
 		 290 aa  97.1  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  32.12 
 
 		 238 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 272 aa  94  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2401  hypothetical protein  38 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1983  nitric-oxide reductase subunit NorC  36.54 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000092612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  28.33 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1229  cytochrome c class I  35.53 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  29.07 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>