48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1469 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  100 
 
 		 144 aa  303  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  65 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  71.53 
 
 		 141 aa  197  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  61.27 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  61.27 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0121  nitric-oxide reductase  61.97 
 
 		 146 aa  189  8e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.281519  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  56.95 
 
 		 148 aa  187  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  53.79 
 
 		 149 aa  174  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0224  nitric-oxide reductase, small subunit  52.74 
 
 		 150 aa  163  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.501338  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  54.11 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  52.05 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1981  nitric-oxide reductase  56.25 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  52.05 
 
 		 150 aa  160  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1850  nitric-oxide reductase  54.11 
 
 		 173 aa  159  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2484  nitric-oxide reductase  53.74 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  59.42 
 
 		 142 aa  156  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1515  nitric-oxide reductase  50.68 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2117  nitric-oxide reductase  49.66 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  47.95 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3183  nitric-oxide reductase subunit C  48.28 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1641  nitric-oxide reductase, small subunit  51.37 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0970  hypothetical protein  47.59 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1969  nitric-oxide reductase  45.89 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0324  nitric oxide reductase subunit C, cytochrome c  45.89 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  38.97 
 
 		 277 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  34.31 
 
 		 272 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  36.97 
 
 		 290 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  36.97 
 
 		 290 aa  104  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  38.97 
 
 		 253 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  35.51 
 
 		 238 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  36.23 
 
 		 238 aa  96.7  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2401  hypothetical protein  33.87 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  29.55 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1983  nitric-oxide reductase subunit NorC  34.95 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000092612  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  27.97 
 
 		 535 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.85 
 
 		 487 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  27.12 
 
 		 535 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1194  hypothetical protein  35.14 
 
 		 264 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.12 
 
 		 487 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.12 
 
 		 487 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.12 
 
 		 535 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.12 
 
 		 535 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  27.12 
 
 		 535 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3450  cytochrome c, class I  27.91 
 
 		 326 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  27.59 
 
 		 326 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 		 311 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  29.76 
 
 		 352 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 381 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>