35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2484 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2484  nitric-oxide reductase  100 
 
 		 150 aa  317  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3183  nitric-oxide reductase subunit C  66 
 
 		 150 aa  226  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  66.67 
 
 		 150 aa  224  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0224  nitric-oxide reductase, small subunit  68 
 
 		 150 aa  224  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.501338  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  67.33 
 
 		 150 aa  222  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  66.67 
 
 		 150 aa  221  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0970  hypothetical protein  66 
 
 		 147 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0324  nitric oxide reductase subunit C, cytochrome c  65.33 
 
 		 150 aa  214  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115359  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1969  nitric-oxide reductase  64.67 
 
 		 150 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  61.33 
 
 		 150 aa  205  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1850  nitric-oxide reductase  60 
 
 		 173 aa  202  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1515  nitric-oxide reductase  58.67 
 
 		 150 aa  195  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1641  nitric-oxide reductase, small subunit  63.33 
 
 		 150 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2117  nitric-oxide reductase  53.33 
 
 		 150 aa  179  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916968 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  53.64 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0121  nitric-oxide reductase  51.33 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.281519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  53.74 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  50.33 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  49.01 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  49.01 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  56 
 
 		 141 aa  148  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  49.33 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  49.67 
 
 		 142 aa  137  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1981  nitric-oxide reductase  48.34 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  37.67 
 
 		 277 aa  100  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  35.81 
 
 		 272 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  36.57 
 
 		 290 aa  89.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  36.57 
 
 		 290 aa  89.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 238 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 238 aa  83.6  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  31.37 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2401  hypothetical protein  31.53 
 
 		 200 aa  67  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  25.78 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1983  nitric-oxide reductase subunit NorC  31.07 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000092612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  27.73 
 
 		 136 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>