36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1983 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1983  nitric-oxide reductase subunit NorC  100 
 
 		 228 aa  479  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000092612  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2401  hypothetical protein  45.21 
 
 		 200 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  30.57 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  30.57 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  32.86 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  35.58 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  35.54 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  36.54 
 
 		 142 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  34.71 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1641  nitric-oxide reductase, small subunit  36.89 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  33.01 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  30.28 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  33.98 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  34.45 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0224  nitric-oxide reductase, small subunit  33.01 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.501338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  36.19 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  36.11 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2117  nitric-oxide reductase  34.31 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0121  nitric-oxide reductase  32.38 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.281519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1850  nitric-oxide reductase  33.33 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  34.62 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  34.95 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  34.95 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  32.04 
 
 		 150 aa  58.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  31.09 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3183  nitric-oxide reductase subunit C  31.58 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1981  nitric-oxide reductase  34.62 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1969  nitric-oxide reductase  32.43 
 
 		 150 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0324  nitric oxide reductase subunit C, cytochrome c  32.43 
 
 		 150 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115359  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0970  hypothetical protein  33.03 
 
 		 147 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2484  nitric-oxide reductase  31.07 
 
 		 150 aa  52  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  30.56 
 
 		 148 aa  52  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1515  nitric-oxide reductase  26.73 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  28 
 
 		 382 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  28 
 
 		 382 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>