37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0624 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  100 
 
 
146 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  99.32 
 
 
146 aa  303  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  66.89 
 
 
148 aa  220  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  61.74 
 
 
149 aa  204  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  57.53 
 
 
141 aa  193  7e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  61.27 
 
 
144 aa  192  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0121  nitric-oxide reductase  59.59 
 
 
146 aa  186  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.281519  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1981  nitric-oxide reductase  58.78 
 
 
148 aa  176  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  53.33 
 
 
150 aa  174  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1850  nitric-oxide reductase  54 
 
 
173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0224  nitric-oxide reductase, small subunit  52.67 
 
 
150 aa  170  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.501338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  52 
 
 
150 aa  170  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  52 
 
 
150 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  52 
 
 
150 aa  168  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  58.9 
 
 
141 aa  163  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1515  nitric-oxide reductase  50.67 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2117  nitric-oxide reductase  49.33 
 
 
150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.916968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1641  nitric-oxide reductase, small subunit  53.33 
 
 
150 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2484  nitric-oxide reductase  49.01 
 
 
150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3183  nitric-oxide reductase subunit C  47.02 
 
 
150 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  54.79 
 
 
142 aa  147  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0970  hypothetical protein  46.31 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1969  nitric-oxide reductase  45.33 
 
 
150 aa  143  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0324  nitric oxide reductase subunit C, cytochrome c  45.33 
 
 
150 aa  143  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  38.73 
 
 
277 aa  110  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  37.23 
 
 
272 aa  99.8  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  37.5 
 
 
253 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  38.21 
 
 
290 aa  94.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  38.21 
 
 
290 aa  94.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  34.75 
 
 
238 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  34.04 
 
 
238 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  32.35 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2401  hypothetical protein  34.82 
 
 
200 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1983  nitric-oxide reductase subunit NorC  34.45 
 
 
228 aa  60.1  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000092612  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  34.88 
 
 
311 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2122  cytochrome c, class I  21.65 
 
 
312 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.959895  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  25 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.969799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>