40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1981 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1981  nitric-oxide reductase  100 
 
 		 148 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  68.92 
 
 		 148 aa  230  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  69.8 
 
 		 149 aa  229  8.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  58.78 
 
 		 146 aa  197  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  58.11 
 
 		 146 aa  195  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  55.41 
 
 		 141 aa  183  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0121  nitric-oxide reductase  54.05 
 
 		 146 aa  180  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.281519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  56.25 
 
 		 144 aa  177  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  57.43 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1850  nitric-oxide reductase  52.67 
 
 		 173 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0224  nitric-oxide reductase, small subunit  50 
 
 		 150 aa  160  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.501338  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  50 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  48.67 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  48.67 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  48.68 
 
 		 150 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2484  nitric-oxide reductase  48.34 
 
 		 150 aa  150  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3183  nitric-oxide reductase subunit C  48.34 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  52.35 
 
 		 142 aa  146  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1515  nitric-oxide reductase  45.33 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1641  nitric-oxide reductase, small subunit  48.67 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0970  hypothetical protein  46.31 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1969  nitric-oxide reductase  46 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0324  nitric oxide reductase subunit C, cytochrome c  46 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115359  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2117  nitric-oxide reductase  41.33 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  37.86 
 
 		 272 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  37.86 
 
 		 277 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  41.41 
 
 		 290 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  41.41 
 
 		 290 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  34.97 
 
 		 238 aa  97.1  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 253 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  32.87 
 
 		 238 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2401  hypothetical protein  32.73 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  28.71 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1983  nitric-oxide reductase subunit NorC  34.95 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000092612  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 		 346 aa  43.5  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 		 311 aa  41.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  28.7 
 
 		 535 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  29.47 
 
 		 535 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  31.18 
 
 		 326 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  27.66 
 
 		 356 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>