52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0970 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0970  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  310  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0324  nitric oxide reductase subunit C, cytochrome c  91.33 
 
 
150 aa  285  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115359  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1969  nitric-oxide reductase  90.67 
 
 
150 aa  283  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3183  nitric-oxide reductase subunit C  66.67 
 
 
150 aa  226  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2484  nitric-oxide reductase  66 
 
 
150 aa  214  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  66 
 
 
150 aa  209  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0224  nitric-oxide reductase, small subunit  63.33 
 
 
150 aa  203  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.501338  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  60.67 
 
 
150 aa  202  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  62.67 
 
 
150 aa  201  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  64 
 
 
150 aa  201  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1515  nitric-oxide reductase  58 
 
 
150 aa  189  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1850  nitric-oxide reductase  54.67 
 
 
173 aa  180  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1641  nitric-oxide reductase, small subunit  62 
 
 
150 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2117  nitric-oxide reductase  53.33 
 
 
150 aa  175  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.916968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0121  nitric-oxide reductase  51.68 
 
 
146 aa  157  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.281519  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  50.33 
 
 
141 aa  153  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  48.37 
 
 
148 aa  147  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  46.31 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  46.31 
 
 
146 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  47.59 
 
 
144 aa  141  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  43.33 
 
 
149 aa  141  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  49.66 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  43.33 
 
 
142 aa  119  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1981  nitric-oxide reductase  46.31 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  36.05 
 
 
272 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  35.86 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  38.76 
 
 
290 aa  87  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  38.76 
 
 
290 aa  87  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  30.2 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  30.2 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  31.97 
 
 
253 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2401  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  27.45 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1983  nitric-oxide reductase subunit NorC  33.03 
 
 
228 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000092612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  34.17 
 
 
535 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  34.17 
 
 
535 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.17 
 
 
487 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.17 
 
 
535 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  34.17 
 
 
535 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.17 
 
 
487 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.17 
 
 
535 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.97 
 
 
487 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1546  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  27.48 
 
 
255 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1618  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  27.48 
 
 
255 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  27.48 
 
 
255 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1434  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  27.48 
 
 
255 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0832764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3765  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  28.24 
 
 
255 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1449  cytochrome c class I  28.24 
 
 
255 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150697  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  30.85 
 
 
371 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1580  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  28.24 
 
 
255 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1651  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  28.24 
 
 
255 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1248  cytochrome c class I  30.86 
 
 
255 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>