20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1813 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1813  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 952 aa  1920    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3566  coenzyme A biosynthesis protein  35.43 
 
 		 957 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0439  Tetratricopeptide domain protein  33.25 
 
 		 1090 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3076  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 		 1108 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0542  hypothetical protein  34.52 
 
 		 922 aa  435  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2960  cellulose binding, type IV  31.43 
 
 		 952 aa  432  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1225  hypothetical protein  34.99 
 
 		 941 aa  428  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1229  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 1016 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.748097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1601  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 939 aa  263  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3961  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.53 
 
 		 1058 aa  99  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.357683  normal  0.258592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3386  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 		 1162 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3322  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 		 1193 aa  58.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.51 
 
 		 1192 aa  58.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215973  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3466  TPR repeat-containing protein  20.35 
 
 		 1191 aa  54.7  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 4079 aa  53.5  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1651  TPR domain-containing protein  29.55 
 
 		 995 aa  50.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.874566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.88 
 
 		 1000 aa  49.3  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.11 
 
 		 1737 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  25.26 
 
 		 719 aa  46.2  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  25.2 
 
 		 318 aa  45.8  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>