41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1022 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1022  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
251 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0829  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.08 
 
 
222 aa  206  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1154  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50 
 
 
222 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.339133  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0059  condensin subunit ScpA  50 
 
 
222 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0764  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.43 
 
 
222 aa  184  9e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.705704  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.44 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  27.73 
 
 
339 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.32 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  23.9 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.79 
 
 
238 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  21.6 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.68 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0325  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.2 
 
 
202 aa  52.8  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  22.63 
 
 
263 aa  52  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.86 
 
 
299 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.43 
 
 
386 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.18 
 
 
202 aa  50.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  21.72 
 
 
297 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  43.48 
 
 
285 aa  48.5  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02231  hypothetical protein  21.43 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3204  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.91 
 
 
204 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.1 
 
 
322 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.51 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  20.56 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  23.85 
 
 
275 aa  46.2  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  20.81 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  20.34 
 
 
285 aa  45.4  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  23.01 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl550  chromosomal segregation/condensation protein  29.51 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000452065  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.44 
 
 
405 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf010  segregation and condensation protein A  26.87 
 
 
273 aa  43.1  0.004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.4 
 
 
297 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.31 
 
 
290 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  21.58 
 
 
291 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  21.58 
 
 
291 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.96 
 
 
364 aa  42  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  21.58 
 
 
291 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  21.58 
 
 
291 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  21.58 
 
 
291 aa  42  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  21.58 
 
 
291 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  21.58 
 
 
291 aa  42  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>