More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0110 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0110  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
441 aa  873    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0240951  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl087  cysteinyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 
441 aa  507  9.999999999999999e-143  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.29436  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
466 aa  319  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
466 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
466 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
466 aa  317  3e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0138  cysteinyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
436 aa  317  4e-85  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.408298  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
468 aa  317  4e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
466 aa  316  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 
466 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
465 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 
466 aa  312  5.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 
466 aa  312  5.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
468 aa  308  8e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
472 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
465 aa  306  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
465 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
465 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
465 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
470 aa  300  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
465 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
465 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
465 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
465 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf132  cysteinyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
401 aa  300  4e-80  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
465 aa  300  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
501 aa  299  7e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
447 aa  295  1e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 
465 aa  294  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
447 aa  293  6e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
465 aa  292  6e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 
474 aa  292  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 
479 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
459 aa  290  4e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
485 aa  290  4e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 
481 aa  289  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 
485 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
460 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
456 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
458 aa  288  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 
485 aa  286  8e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 
456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0635  cysteinyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
457 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
462 aa  284  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
493 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 
472 aa  283  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 
485 aa  282  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
499 aa  282  1e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
500 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
468 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 
460 aa  280  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 
487 aa  281  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 
478 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 
468 aa  281  2e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 
474 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 
476 aa  280  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
498 aa  277  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
478 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
472 aa  277  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 
484 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
448 aa  276  5e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 
460 aa  276  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1273  cysteinyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
481 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0967  cysteinyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
462 aa  276  7e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0501799 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 
484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 
461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 
493 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
455 aa  274  3e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 
478 aa  273  5.000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
486 aa  273  6e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
488 aa  273  6e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 
480 aa  273  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 
486 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 
494 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
495 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2221  cysteinyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
462 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.312209  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
454 aa  271  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
469 aa  271  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1875  cysteinyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
462 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000229747  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2590  cysteinyl-tRNA synthetase  35 
 
 
481 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0727872  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
469 aa  270  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 
494 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2683  cysteinyl-tRNA synthetase  35 
 
 
481 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025433  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 
489 aa  270  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
460 aa  270  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 
463 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 
480 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0749  cysteinyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
500 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 
461 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>