42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2756 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  951    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3131  hypothetical protein  23.26 
 
 
403 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242131  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  27.62 
 
 
411 aa  95.5  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  28.75 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  25.37 
 
 
424 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  25.15 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  23.15 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  23.98 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  25.67 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  32 
 
 
379 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  27.74 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  25.62 
 
 
383 aa  65.1  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  26.16 
 
 
386 aa  64.7  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  25.76 
 
 
389 aa  64.3  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  25.22 
 
 
383 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  25.22 
 
 
383 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  25.22 
 
 
383 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  24.61 
 
 
381 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  27.35 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  24.87 
 
 
381 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  24.38 
 
 
435 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  28.14 
 
 
384 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  26.2 
 
 
394 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  22.29 
 
 
485 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  21.66 
 
 
437 aa  57  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  23.29 
 
 
388 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  22.78 
 
 
387 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  26.58 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  25.95 
 
 
374 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  24.92 
 
 
416 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  24.92 
 
 
416 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  24.58 
 
 
416 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  23.03 
 
 
393 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  21.85 
 
 
396 aa  50.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  25.87 
 
 
334 aa  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  27.83 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  20.24 
 
 
397 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  25.73 
 
 
336 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  22.89 
 
 
419 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  21.71 
 
 
409 aa  47  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  25.4 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  24.34 
 
 
383 aa  43.9  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>