45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03949 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03949  osmolarity sensor protein  100 
 
 		 392 aa  772    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3382  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7075  major facilitator family transporter  26.86 
 
 		 370 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  21.95 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2340  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 417 aa  53.9  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  21.32 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  25.43 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  22.73 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  25 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3472  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.2382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  24.8 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  24.8 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3249  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  27.25 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0010  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  27.53 
 
 		 424 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  30 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  26.95 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  26.95 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 386 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1131  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  27.01 
 
 		 411 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122679 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  26.95 
 
 		 402 aa  43.5  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 473 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3791  hypothetical protein  24.48 
 
 		 394 aa  43.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 474 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1720  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 474 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 474 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 402 aa  43.1  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 400 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 473 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 437 aa  42.7  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>