More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03130 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03130  probable arginase family protein  100 
 
 
334 aa  698    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1018  formiminoglutamase  54.03 
 
 
326 aa  338  9e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  44.95 
 
 
311 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  44.48 
 
 
311 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  42.17 
 
 
325 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  43.2 
 
 
325 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  44.8 
 
 
336 aa  236  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0706  formimidoylglutamase  41.74 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.979825  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003721  formiminoglutamase  43.39 
 
 
336 aa  233  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  41.67 
 
 
325 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1031  formimidoylglutamase  43.77 
 
 
348 aa  232  8.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.454798  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02074  formimidoylglutamase  41.79 
 
 
345 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  40.8 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  38.91 
 
 
319 aa  212  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  38.91 
 
 
319 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  37.97 
 
 
358 aa  203  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  39.1 
 
 
315 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  39.56 
 
 
316 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  38.55 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  36.09 
 
 
325 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  39.1 
 
 
315 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  37.39 
 
 
329 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  41.26 
 
 
322 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  36.47 
 
 
322 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  40.12 
 
 
325 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1933  formimidoylglutamase  35.82 
 
 
363 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.541509  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  35.29 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  36.65 
 
 
311 aa  176  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  39.38 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  40.51 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  36.61 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  35.8 
 
 
313 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  35.8 
 
 
313 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  35.8 
 
 
313 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  35.8 
 
 
313 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  35.49 
 
 
313 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  38.05 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  34.35 
 
 
311 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  34.35 
 
 
311 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  37.31 
 
 
317 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.3 
 
 
316 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.56 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4106  formiminoglutamase  29.15 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1481  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.86 
 
 
267 aa  86.7  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.354652 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3835  formiminoglutamase  26.06 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4042  formiminoglutamase  26.11 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.954236  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  24.14 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  24.34 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  24.82 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  24.16 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  24.16 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  24.16 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  24.16 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  25.56 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  23.97 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.52 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  24.54 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  24.82 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  24.34 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0925  putative agmatinase  27.24 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0743  agmatinase  23.72 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618135  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1543  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.01 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0983244  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  25.69 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  24.83 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  26.22 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  23.97 
 
 
288 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  25.32 
 
 
297 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  24.44 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  25.18 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  25.44 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  24.41 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  24.83 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  28.52 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  26.91 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0814  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.67 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237989  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2212  agmatinase  23 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000352659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  23 
 
 
365 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  25.43 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  25.43 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  24.47 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  25.43 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  25.35 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  23 
 
 
365 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  23 
 
 
365 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  23.99 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  26.73 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  26.67 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  23.05 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  25.09 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  25.09 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  25.26 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  25.25 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  25.26 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  25.26 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0509  putative agmatinase  25.86 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  24.85 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  25.77 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  24.74 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  25.6 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  25.17 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>