29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02802 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02802  Choline kinase involved in LPS biosynthesis  100 
 
 		 240 aa  498  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.994431  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1347  aminoglycoside phosphotransferase  31.98 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.743543  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  28 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1409  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  28.06 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  25.35 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  26.77 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01523  hypothetical protein  27.47 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  29.89 
 
 		 293 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1717  aminoglycoside phosphotransferase  27.21 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42574  predicted protein  38.36 
 
 		 421 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.202848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf798  PTS lichenan-specific IIa component  29.23 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5537  aminoglycoside phosphotransferase  26.36 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  26.71 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  26.71 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  39.13 
 
 		 595 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  25.89 
 
 		 289 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1307  putative antibiotic resistance protein  28.32 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2040  aminoglycoside phosphotransferase  31.34 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf796  hypothetical protein  27.08 
 
 		 484 aa  43.5  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1529  hypothetical protein  23.53 
 
 		 332 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  27.1 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1230  trifolitoxin immunity domain-containing protein  30.86 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000170799  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3408  aminoglycoside phosphotransferase-like  29.21 
 
 		 263 aa  42.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1605  Thiamine kinase  29.24 
 
 		 287 aa  42  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1483  hypothetical protein  25.97 
 
 		 286 aa  42  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0577113  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1296  aminoglycoside phosphotransferase  36.96 
 
 		 295 aa  42  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  19.05 
 
 		 622 aa  42  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>