169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01883 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  46.15 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  47.64 
 
 		 290 aa  259  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  45.79 
 
 		 290 aa  259  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  42.53 
 
 		 282 aa  231  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  41.89 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  35.97 
 
 		 422 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  35.97 
 
 		 422 aa  168  8e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  35.97 
 
 		 424 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  35 
 
 		 357 aa  162  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  35 
 
 		 357 aa  162  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  35 
 
 		 357 aa  162  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  34.64 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  34.64 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  34.64 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  34.64 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  34.64 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  33.56 
 
 		 373 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  34.64 
 
 		 357 aa  159  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  34.67 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  34.33 
 
 		 357 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  34.33 
 
 		 364 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  34.33 
 
 		 357 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  34.33 
 
 		 364 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  32.85 
 
 		 356 aa  152  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  32.35 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  33.09 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  32.35 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  32.35 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  31.99 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  31.99 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  31.99 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  31.99 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  33.22 
 
 		 638 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  31.99 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  32.35 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  31.99 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  28.87 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  30.04 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  30.19 
 
 		 378 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  31.84 
 
 		 289 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  30.11 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  33 
 
 		 381 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  33 
 
 		 383 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  28.03 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  29.26 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  31.09 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  30.71 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  29.06 
 
 		 283 aa  122  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  30.34 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  30.34 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  28.98 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  28.1 
 
 		 283 aa  119  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  26.67 
 
 		 372 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  29.23 
 
 		 415 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  28.06 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  26.52 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  27.02 
 
 		 383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  30.74 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  26.52 
 
 		 372 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  28.3 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  27.55 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  29.59 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  30.37 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  30.37 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  27.56 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  30.37 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  26.81 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  30.8 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  26.77 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  29.21 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  32.34 
 
 		 389 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  27.1 
 
 		 335 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  26.42 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  28.83 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  26.42 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  26.42 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  26.97 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  29.75 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  25.88 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  28.01 
 
 		 313 aa  99.4  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  27.04 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  28.04 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  27.99 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.07 
 
 		 303 aa  95.9  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  26.5 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0266793  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  26.06 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  22.07 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  32.22 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  26.67 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  31.11 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  26.96 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  27.37 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  30.05 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  25.61 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  30.51 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  26.61 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  30.51 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  28.96 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  29.38 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>