More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01039 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01039  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
393 aa  815    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0082  aminotransferase class I and II  35.03 
 
 
390 aa  217  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6129  aminotransferase class I and II  35.46 
 
 
390 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.849535  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2627  aminotransferase class I and II  37.03 
 
 
395 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3457  aminotransferase  34.94 
 
 
342 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01458  putative aminotransferase  33.63 
 
 
391 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
362 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.95 
 
 
369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0217  aminotransferase, class I and II  30.65 
 
 
367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  32.63 
 
 
386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  33.94 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2352  aminotransferase class I and II  30.73 
 
 
394 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.218999  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  32.84 
 
 
362 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  31.64 
 
 
370 aa  160  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
362 aa  160  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
363 aa  160  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2051  aminotransferase class I and II  30.21 
 
 
394 aa  160  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  29.85 
 
 
386 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  31.75 
 
 
370 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3478  aminotransferase class I and II  30.08 
 
 
379 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.53524  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  31.42 
 
 
351 aa  157  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  33.83 
 
 
374 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  31.75 
 
 
370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  31.45 
 
 
370 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  31.45 
 
 
370 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  32.13 
 
 
370 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  31.45 
 
 
370 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  31.16 
 
 
370 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  32.05 
 
 
370 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  31.27 
 
 
355 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1077  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 
369 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  29.31 
 
 
372 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3969  histidinol-phosphate aminotransferase  31.99 
 
 
357 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  31.94 
 
 
370 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1862  aminotransferase  29.12 
 
 
365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  32.24 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31820  putative aminotransferase  30.67 
 
 
374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437419  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  30.97 
 
 
370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  33.13 
 
 
359 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  34.03 
 
 
369 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  30.84 
 
 
366 aa  147  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3654  aminotransferase class I and II  31.83 
 
 
411 aa  146  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  32.84 
 
 
371 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  31.72 
 
 
370 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0738  aminotransferase, class I and II  29.24 
 
 
350 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  31.62 
 
 
362 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  31.04 
 
 
366 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  30.95 
 
 
363 aa  143  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  33.93 
 
 
370 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  29.08 
 
 
375 aa  143  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  33.12 
 
 
359 aa  143  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3031  putative aminotransferase  31.28 
 
 
387 aa  143  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0235  histidinol-phosphate transaminase  30.42 
 
 
365 aa  142  7e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  31.53 
 
 
365 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  30.42 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  28.78 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  29.22 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  32.92 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  30.91 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  29.17 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  31.81 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25490  aminotransferase  31.25 
 
 
363 aa  141  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0349529  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  34.03 
 
 
369 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  30.75 
 
 
366 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  31.04 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
352 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
352 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4291  histidinol-phosphate aminotransferase  32.04 
 
 
376 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  32.24 
 
 
374 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  33.13 
 
 
369 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  31.1 
 
 
365 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  30.47 
 
 
358 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 
365 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  30.14 
 
 
362 aa  138  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0381  histidinol-phosphate aminotransferase  32.71 
 
 
353 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  31.34 
 
 
370 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  32.53 
 
 
374 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  28.44 
 
 
367 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  30.88 
 
 
373 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0302  histidinol-phosphate aminotransferase  32.71 
 
 
355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  31.31 
 
 
370 aa  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  30.7 
 
 
391 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  30.73 
 
 
363 aa  137  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  30.95 
 
 
365 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  30.95 
 
 
365 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  32.04 
 
 
370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  32.34 
 
 
351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  31.52 
 
 
352 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  30.5 
 
 
377 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1329  aminotransferase class I and II  32.26 
 
 
345 aa  135  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.519035  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4514  aminotransferase  32.45 
 
 
356 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.550747  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3575  histidinol-phosphate aminotransferase  30.42 
 
 
374 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.522328  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  31.25 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  31.93 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0971  aminotransferase  31.1 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  30.75 
 
 
370 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  30.15 
 
 
366 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  30.15 
 
 
366 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4751  aminotransferase class I and II  29.22 
 
 
383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000197662  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  30.15 
 
 
366 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>