42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5741 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5741  phasin  100 
 
 
116 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  77.59 
 
 
116 aa  180  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  76.72 
 
 
116 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  77.59 
 
 
116 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  68.1 
 
 
116 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  58.12 
 
 
120 aa  130  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  55.17 
 
 
147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  55.17 
 
 
162 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  52.59 
 
 
147 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  51.92 
 
 
107 aa  105  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  54.31 
 
 
158 aa  104  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  54.31 
 
 
158 aa  104  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  47.83 
 
 
118 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  53.45 
 
 
158 aa  103  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  44.55 
 
 
128 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  41.82 
 
 
123 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  45.69 
 
 
117 aa  95.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  48.28 
 
 
162 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  43.24 
 
 
118 aa  90.5  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  42.24 
 
 
118 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  42.24 
 
 
118 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  40.35 
 
 
210 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5817  hypothetical protein  42.27 
 
 
117 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41591  normal  0.243698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  33.33 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  33.33 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  34.51 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  31.86 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  32.74 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  33.9 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  34.19 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  34.26 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  31.19 
 
 
184 aa  57  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  29.81 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0093  hypothetical protein  28.12 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  29.81 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  30.09 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0683  hypothetical protein  27.08 
 
 
113 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.551573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  26.55 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  24.51 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  29.13 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  26.17 
 
 
173 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0784  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>