85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1964 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1964  YciI-like protein  100 
 
 		 98 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0268775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3336  YciI-like protein  51.11 
 
 		 94 aa  95.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1484  YCII-related  47.06 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4138  YciI-like protein  43.68 
 
 		 100 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  40.91 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2936  YCII-related  43.16 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366062 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0349  YCII-related  40.91 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117394  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  39.53 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0330  YciI-like protein  40 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0863  YciI-like protein  42.53 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0037  YCII-related  39.08 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1115  YciI-like protein  34.48 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.176684  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  39.53 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  39.53 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  32.18 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2083  YCII-related protein  36.47 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  39.53 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0115  YCII-related  42.71 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.011377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  42.05 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  37.23 
 
 		 192 aa  53.9  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2831  YciI-like protein  38.37 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2904  YCII-related  36.63 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.087124  normal  0.332831 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2000  YCII-related  32.22 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2848  YCII-related protein  34.44 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413874  normal  0.43618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  31.82 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  34.12 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  32.56 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  32.94 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1508  YciI-like protein  35.29 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  30.68 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1410  YciI-like protein  36.56 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0448344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2417  YciI-like protein  35.48 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.384464  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  32.94 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4502  YciI-like protein  36.56 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  35.29 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  35.48 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2019  YCII-related  35.48 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0263294  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  33.72 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22780  YciI-like protein  36.56 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.064842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3791  YciI-like protein  35.48 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000137608 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1459  YCII-related protein  29.7 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1924  YciI-like protein  36.56 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0914031  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  34.41 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7466  hypothetical protein  31.11 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0787  YCII-related  34.09 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  31.76 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  31.76 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1420  YciI-like protein  32.26 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374625  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3760  YciI-like protein  38.89 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067977 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  37.08 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2138  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  32.26 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2397  YCII-related protein  32.26 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00577394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3036  YciI-like protein  34.41 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2186  YCII-related  33.33 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.054491  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01235  hypothetical protein  32.26 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.947238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1485  YciI-like protein  37.89 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00728644  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1650  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239364  hitchhiker  0.0000000000431009 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1448  YciI-like protein  34.41 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1514  YciI-like protein  34.41 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00336778  normal  0.766184 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1738  YciI-like protein  32.26 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000940288  normal  0.0139012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2815  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000129416  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2736  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000268578  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01225  predicted enzyme  32.26 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2376  YciI-like protein  32.26 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115625  hitchhiker  0.0000012139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1881  YciI-like protein  32.26 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1504  YciI-like protein  34.41 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2714  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0349915  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1833  YciI-like protein  34.41 
 
 		 99 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.855778  normal  0.363784 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1645  hypothetical protein  34.41 
 
 		 100 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.290819  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02294  hypothetical protein  34.07 
 
 		 96 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0718  YciI-like protein  34.04 
 
 		 99 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.532819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1010  YCII-related  30.85 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000895007  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1590  YciI-like protein  28.87 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.818061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  28.87 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4760  YCII-related  33.33 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0861081  hitchhiker  0.000000338783 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  28.87 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  28.87 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  28.87 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  31.18 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1360  YciI-like protein  31.18 
 
 		 98 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1145  YciI-like protein  31.37 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  29.03 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2262  YciI-like protein  34.41 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147649  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  32.26 
 
 		 99 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>