39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1257 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  226  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  72.41 
 
 		 116 aa  175  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  68.1 
 
 		 116 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  74.14 
 
 		 116 aa  157  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  74.14 
 
 		 116 aa  157  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  56.14 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  50.96 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  48.25 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  48.62 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  45.69 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  43.97 
 
 		 162 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  44.74 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  48.28 
 
 		 158 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  39.45 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  47.71 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  40.52 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  40.52 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  47.71 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  37.72 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  41.38 
 
 		 117 aa  83.6  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  39.82 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  37.27 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  36.84 
 
 		 210 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5817  hypothetical protein  36.08 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41591  normal  0.243698 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  33.93 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  31.19 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  30 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  28.85 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  31.48 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  28.44 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  28.18 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  26.17 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  28.7 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  26.09 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  27.88 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  25.96 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  27.27 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  24.3 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0784  hypothetical protein  28.7 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>