More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1589 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1589  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
351 aa  724    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0949  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  63.79 
 
 
345 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  63.29 
 
 
345 aa  451  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0844  threonine dehydrogenase  56.98 
 
 
347 aa  393  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1641  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  54.88 
 
 
326 aa  369  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.13 
 
 
340 aa  320  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3360  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.69 
 
 
338 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06010  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  45.01 
 
 
351 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0624  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  46.31 
 
 
338 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2673  alcohol dehydrogenase  46.36 
 
 
338 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.25 
 
 
347 aa  300  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1854  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.26 
 
 
348 aa  299  5e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.4 
 
 
346 aa  290  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0696766 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2438  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.61 
 
 
347 aa  286  4e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.931486  hitchhiker  0.00356491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2284  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.02 
 
 
338 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.399136 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16630  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  44.32 
 
 
349 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.1 
 
 
338 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0477  alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 
351 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2318  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.22 
 
 
338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263931  normal  0.648846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  44.19 
 
 
339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2100  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.27 
 
 
340 aa  272  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1970  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.74 
 
 
341 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  40.46 
 
 
340 aa  265  8e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3625  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  41.81 
 
 
340 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698872  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0265  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.97 
 
 
345 aa  263  2e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0894063  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20300  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  44.64 
 
 
340 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.34 
 
 
349 aa  257  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.862427  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1473  alcohol dehydrogenase  39.36 
 
 
340 aa  253  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.308593  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2717  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.16 
 
 
341 aa  253  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3749  alcohol dehydrogenase  43.97 
 
 
345 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4121  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.67 
 
 
345 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.991808 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.19 
 
 
353 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1032  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.09 
 
 
344 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0184  alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 
338 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0185  alcohol dehydrogenase  38.95 
 
 
340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.62 
 
 
347 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.09 
 
 
379 aa  182  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
346 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
346 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
346 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.9 
 
 
342 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  32.57 
 
 
345 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  30.27 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.46 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.11 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.11 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  32.89 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.57 
 
 
346 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.09 
 
 
347 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.5 
 
 
351 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  30.34 
 
 
372 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 
347 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.26 
 
 
346 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
351 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.75 
 
 
417 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.61 
 
 
351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.91 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.24 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.56 
 
 
349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  30.1 
 
 
415 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.22 
 
 
410 aa  162  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  30.11 
 
 
343 aa  162  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.06 
 
 
345 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.86 
 
 
346 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4723  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.9 
 
 
387 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.592653  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.86 
 
 
346 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.86 
 
 
346 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.86 
 
 
346 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.86 
 
 
346 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.86 
 
 
346 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  31.36 
 
 
346 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  33.94 
 
 
444 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0147  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.23 
 
 
390 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.88 
 
 
410 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.2 
 
 
405 aa  157  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 
422 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1837  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.13 
 
 
389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607752  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  29.58 
 
 
415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.77 
 
 
398 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.4 
 
 
376 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
402 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1246  zinc-type alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
385 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939827  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  31.36 
 
 
356 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  26.07 
 
 
346 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.9 
 
 
390 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04540  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02810)  35.23 
 
 
355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.825375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.77 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.71 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.79 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3155  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.95 
 
 
377 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.633298  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.77 
 
 
390 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
390 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3133  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.95 
 
 
377 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1755  alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 
403 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 
357 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>