More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1070 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1070  integrase catalytic subunit  100 
 
 
283 aa  596  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00450828  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1339  integrase catalytic subunit  97.88 
 
 
283 aa  561  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1656  integrase catalytic subunit  76.23 
 
 
223 aa  370  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0441  integrase catalytic subunit  45.56 
 
 
254 aa  224  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0848  transposase  31.21 
 
 
289 aa  129  6e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.556417  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0841  transposase  31.27 
 
 
289 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0546  transposase  31.27 
 
 
289 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0112  transposase  31.27 
 
 
289 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1194  integrase catalytic region  32.62 
 
 
293 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0470498  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0025  ISSod1, transposase OrfA  29.18 
 
 
386 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.137209  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  29.18 
 
 
386 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  29.18 
 
 
386 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  29.18 
 
 
386 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  29.18 
 
 
386 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  29.18 
 
 
386 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  28.83 
 
 
386 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  28.83 
 
 
386 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  28.83 
 
 
386 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  28.83 
 
 
386 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  28.83 
 
 
386 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  28.83 
 
 
386 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  28.83 
 
 
386 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  28.83 
 
 
386 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  28.83 
 
 
386 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  28.83 
 
 
386 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2172  integrase catalytic region  28.94 
 
 
300 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3175  integrase catalytic region  28.94 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0277511  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  27.86 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3446  transposase  27.84 
 
 
284 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000031866 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1214  integrase core domain protein  27.11 
 
 
294 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000600847  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2805  integrase core domain protein  27.11 
 
 
294 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153033 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  28.52 
 
 
294 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  28.52 
 
 
294 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  28.52 
 
 
294 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  28.52 
 
 
294 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  28.52 
 
 
294 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  28.06 
 
 
296 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  27.24 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  27.24 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  27.24 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  27.24 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  27.24 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  27.24 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  27.24 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  27.24 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  27.24 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  27.24 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4401  transposase IS3/IS911 family protein  28.74 
 
 
346 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.518435 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  27.24 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  27.24 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  27.24 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4045  transposase  27.11 
 
 
294 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1784  transposase  27.11 
 
 
294 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  28.31 
 
 
281 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4660  integrase catalytic region  28.57 
 
 
269 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.462988  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0737  transposase  27.11 
 
 
294 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1689  transposase  27.11 
 
 
294 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4596  integrase catalytic region  28.57 
 
 
269 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.930794 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3205  transposase  27.11 
 
 
294 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0553  transposase  27.11 
 
 
294 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000171843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5175  transposase  27.11 
 
 
294 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5220  transposase  26.37 
 
 
294 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0354  transposase  26.37 
 
 
294 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.163187  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  28.89 
 
 
279 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  28.89 
 
 
279 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  28.89 
 
 
279 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1118  integrase catalytic subunit  27.65 
 
 
269 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2660  integrase catalytic subunit  27.65 
 
 
269 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306484  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0684  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0892  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0983  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1024  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1079  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1083  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1129  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1134  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1465  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1515  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1904  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2026  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2315  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2369  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2462  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2734  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3398  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3570  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3606  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3610  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4183  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4277  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4294  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4300  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4442  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4580  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0024  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0483506  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0029  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0037  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0054  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0066  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0091  ISSod1, transposase OrfB  28.57 
 
 
269 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>