254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2455 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2833  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
236 aa  477  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2455  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
236 aa  477  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.233722  normal  0.737843 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  48.79 
 
 
235 aa  205  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  48.79 
 
 
235 aa  205  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  49.13 
 
 
237 aa  203  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2970  6-phosphogluconolactonase  48.6 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.504923  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  45.05 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  47.06 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  47.71 
 
 
232 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2071  6-phosphogluconolactonase  44.83 
 
 
232 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.834551  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  41.21 
 
 
252 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  40.58 
 
 
248 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  39.11 
 
 
242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  37.3 
 
 
262 aa  115  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  35.47 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2481  6-phosphogluconolactonase  39.36 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.603266  normal  0.14233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  31.33 
 
 
239 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  34.63 
 
 
240 aa  108  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31882  predicted protein  31.82 
 
 
276 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340464  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2299  6-phosphogluconolactonase  39.88 
 
 
221 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.020573  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  38.89 
 
 
241 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  35.4 
 
 
241 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  31.25 
 
 
239 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_006686  CND03390  6-phosphogluconolactonase, putative  32.2 
 
 
294 aa  105  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379587  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  33.62 
 
 
252 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  32.2 
 
 
236 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  36.18 
 
 
494 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  32.2 
 
 
240 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  32.2 
 
 
236 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  31.79 
 
 
241 aa  102  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  33.99 
 
 
245 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  33.99 
 
 
245 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  30.77 
 
 
241 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  33.99 
 
 
245 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  26.16 
 
 
244 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19980  6-phosphogluconolactonase  36.02 
 
 
248 aa  101  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  35.85 
 
 
261 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1976  6-phosphogluconolactonase  38.24 
 
 
225 aa  100  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.731811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  34.87 
 
 
243 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
238 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  33.91 
 
 
249 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  32.66 
 
 
235 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00285  6-phosphogluconolactonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02980)  32.47 
 
 
265 aa  99.4  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.757461 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  35.38 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  34.51 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2165  6-phosphogluconolactonase  33.75 
 
 
250 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2417  6-phosphogluconolactonase  36.06 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.245714 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  30.49 
 
 
373 aa  96.7  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  38.1 
 
 
239 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  38.42 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2482  6-phosphogluconolactonase  31.91 
 
 
303 aa  96.3  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  37.82 
 
 
262 aa  95.9  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1122  6-phosphogluconolactonase  35.59 
 
 
254 aa  95.9  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  34.04 
 
 
245 aa  95.5  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  30.29 
 
 
245 aa  95.1  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  35.74 
 
 
256 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08311  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  27.93 
 
 
245 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.29816  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  29.91 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2282  6-phosphogluconolactonase  28.93 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340949  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  32.77 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  32.72 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08331  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  28.71 
 
 
245 aa  92  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.831569  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  29.29 
 
 
238 aa  92  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  26.98 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0779  6-phosphogluconolactonase  27.88 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82104  6-phosphogluconolactonase-like protein  28.27 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.650309  normal  0.457187 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  34.52 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
243 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  30.48 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  31.68 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  33 
 
 
240 aa  89  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  31.79 
 
 
243 aa  89  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  31.05 
 
 
260 aa  88.6  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0177  6-phosphogluconolactonase  27.31 
 
 
238 aa  88.6  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  37.73 
 
 
240 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1596  6-phosphogluconolactonase  30.98 
 
 
220 aa  88.2  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2926  6-phosphogluconolactonase  34.18 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  31.08 
 
 
245 aa  86.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  35.27 
 
 
429 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  28.57 
 
 
214 aa  86.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  32.06 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  30.28 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  36.1 
 
 
235 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1553  6-phosphogluconolactonase  36.36 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1985  6-phosphogluconolactonase  32.86 
 
 
258 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.446767  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  35.81 
 
 
241 aa  85.5  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2045  6-phosphogluconolactonase  31.47 
 
 
232 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1930  6-phosphogluconolactonase  31.47 
 
 
232 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2150  6-phosphogluconolactonase  31.47 
 
 
232 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00227432  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13316  predicted protein  31.09 
 
 
248 aa  85.1  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0957724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2253  6-phosphogluconolactonase  31.98 
 
 
232 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00179168  hitchhiker  0.00000128399 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4526  hypothetical protein  31.98 
 
 
232 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  27.16 
 
 
238 aa  85.1  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2240  6-phosphogluconolactonase  31.98 
 
 
232 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2125  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2176  6-phosphogluconolactonase  31.98 
 
 
232 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773853  normal  0.0249488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2131  6-phosphogluconolactonase  31.98 
 
 
232 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000254837  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1662  6-phosphogluconolactonase  28.21 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  38.5 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>