52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2325 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2325  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  295  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1090  hypothetical protein  84.85 
 
 		 223 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1594  hypothetical protein  35.91 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1249  hypothetical protein  50.75 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2326  hypothetical protein  41.49 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2338  hypothetical protein  44.05 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1067  hypothetical protein  47.06 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2339  hypothetical protein  63.27 
 
 		 297 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2328  hypothetical protein  88 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1132  hypothetical protein  36.84 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566375  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2324  hypothetical protein  69.44 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0352  hypothetical protein  56.82 
 
 		 285 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.972359  normal  0.0160007 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2252  hypothetical protein  64.71 
 
 		 233 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2327  hypothetical protein  33.99 
 
 		 206 aa  52.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0167  hypothetical protein  82.14 
 
 		 239 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1593  hypothetical protein  74.19 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157492 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  74.07 
 
 		 497 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2731  hypothetical protein  34.44 
 
 		 217 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000468219  unclonable  0.000000144909 
 
 
 
NC_007947  Mfla_1718  hypothetical protein  45.16 
 
 		 226 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000144169  unclonable  0.000000229382 
 
 
 
NC_007404  Tbd_1800  hypothetical protein  47.46 
 
 		 209 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2427  hypothetical protein  60.61 
 
 		 231 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0532981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0506  hypothetical protein  73.08 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40604  normal  0.281124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1804  hypothetical protein  50 
 
 		 227 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.206043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2031  hypothetical protein  55 
 
 		 179 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1803  hypothetical protein  79.17 
 
 		 266 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2096  hypothetical protein  60 
 
 		 259 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0004226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1713  hypothetical protein  72 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2578  hypothetical protein  51.52 
 
 		 294 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0262  hypothetical protein  46.43 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000101412  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1259  hypothetical protein  73.08 
 
 		 208 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0088  hypothetical protein  51.43 
 
 		 211 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2396  hypothetical protein  41.82 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000890188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2728  phosphatase-like  68 
 
 		 462 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.427102  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1190  hypothetical protein  43.06 
 
 		 268 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100853  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1091  hypothetical protein  50 
 
 		 229 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0709  hypothetical protein  66.67 
 
 		 261 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2005  hypothetical protein  58.62 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00997836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1750  hypothetical protein  60 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489319  normal  0.427262 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2195  hypothetical protein  36.51 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1602  hypothetical protein  32.22 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000171448  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  68 
 
 		 326 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0471  hypothetical protein  62.96 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.562548  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  64 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2397  hypothetical protein  41.82 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000007208  normal  1 
 
 
 
NC_007947  Mfla_1203  hypothetical protein  39.68 
 
 		 242 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.743996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1122  hypothetical protein  46 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.182832 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  55.56 
 
 		 288 aa  41.2  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2253  hypothetical protein  45.71 
 
 		 248 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000307297  unclonable  0.000000143416 
 
 
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  56 
 
 		 433 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1390  hypothetical protein  64 
 
 		 379 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000676729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0523  hypothetical protein  34.51 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1123  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.291627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>