189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1661 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1661  nitroreductase  100 
 
 		 214 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.923365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3637  nitroreductase  60.75 
 
 		 192 aa  230  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4587  nitroreductase  54.89 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3754  nitroreductase  49.07 
 
 		 220 aa  191  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1008  nitroreductase  45.11 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0931  hypothetical protein  55.32 
 
 		 189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0434  nitroreductase  53.37 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0443  nitroreductase  53.37 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  39.52 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  34.07 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  38.38 
 
 		 186 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  39.63 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  39.63 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  29.84 
 
 		 187 aa  101  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  34.12 
 
 		 169 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0909  nitroreductase family protein  31.15 
 
 		 184 aa  99  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.968398  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0191  nitroreductase  36.7 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  32.78 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  36.02 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  32.35 
 
 		 169 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04578  nitroreductase family  32.57 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  34.27 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3921  nitroreductase  35.23 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159011  normal  0.0804264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  30.43 
 
 		 194 aa  93.2  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  32.97 
 
 		 188 aa  92  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  33.5 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  31.11 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  28.02 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  37.2 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  28.89 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  29.12 
 
 		 187 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  31.69 
 
 		 187 aa  88.2  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  37.09 
 
 		 185 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  36.42 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  36.18 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  37.09 
 
 		 185 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  34.76 
 
 		 186 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  29.86 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  32.97 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  31.58 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1069  nitroreductase family protein  31.4 
 
 		 194 aa  86.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600572  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  36.18 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  36 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  31.32 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  36.18 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  36.18 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  36.18 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1033  nitroreductase family protein  31.4 
 
 		 194 aa  86.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.680081  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  35.76 
 
 		 185 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  31.58 
 
 		 191 aa  85.5  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  35.91 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  35.53 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  35.53 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  33.51 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  31.98 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2199  nitroreductase  33.33 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0698  nitroreductase  30.46 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  38.41 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  30.22 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  31.87 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  30.77 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  28 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  27.14 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.42931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  31.94 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  31.94 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  29.12 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  32.11 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  31.94 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  33.95 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  31.94 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  31.94 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  31.94 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  31.94 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  31.94 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2152  nitroreductase  31.36 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  30.22 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  33.33 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  33.33 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2315  nitroreductase  30.34 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  31.79 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3754  nitroreductase  30.77 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.951056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1800  nitroreductase  29.78 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1843  nitroreductase  30.51 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32071  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  29.8 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  30.22 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  31.9 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  31.15 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  32.16 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2042  nitroreductase  28.81 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  31.21 
 
 		 191 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  28.02 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  30.22 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  30.22 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0930  nitroreductase  29.69 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  30.22 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7274  nitroreductase  37.34 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573924  normal  0.0842376 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1004  nitroreductase  25.56 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  35.9 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  32.47 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>