More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0629 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 408 aa  827    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  48.74 
 
 		 402 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  48.51 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  47.07 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  46.56 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  42.72 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  44.58 
 
 		 406 aa  355  6.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  45.59 
 
 		 428 aa  350  3e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  43.65 
 
 		 413 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  42.57 
 
 		 405 aa  342  9e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  47.24 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  44.33 
 
 		 415 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  47.99 
 
 		 409 aa  334  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  46.48 
 
 		 407 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  47.01 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  45.04 
 
 		 407 aa  331  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  47.01 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  40.39 
 
 		 412 aa  330  3e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  47.97 
 
 		 413 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  43.86 
 
 		 410 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  43.67 
 
 		 406 aa  326  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  41.97 
 
 		 415 aa  322  7e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  40.48 
 
 		 420 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  42.79 
 
 		 406 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  39.59 
 
 		 432 aa  308  9e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  35.63 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  45.9 
 
 		 405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  38.12 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  41.6 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  41.75 
 
 		 412 aa  280  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  41.53 
 
 		 425 aa  276  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  39.26 
 
 		 437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  37.84 
 
 		 401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 		 417 aa  266  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  38.11 
 
 		 385 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  40.55 
 
 		 412 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  40.48 
 
 		 390 aa  249  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  35.71 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  36.88 
 
 		 518 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  36.81 
 
 		 401 aa  227  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  29.22 
 
 		 412 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.05 
 
 		 421 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  45.97 
 
 		 188 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  45.97 
 
 		 188 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 418 aa  87.4  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 		 370 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 904 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  39.07 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 405 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0308  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 		 364 aa  57  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429385  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  21.86 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  26.18 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 		 438 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 389 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.26 
 
 		 388 aa  53.9  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  30.05 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 366 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 387 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 		 458 aa  53.1  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.51 
 
 		 376 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1904  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 370 aa  53.1  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3803  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.551552 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  22.38 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.7 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.89 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1970  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.63 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.622301  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  28.33 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.89 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  22.7 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>