More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1026 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1026  heat shock protein GrpE  100 
 
 
190 aa  379  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000103235  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  75.52 
 
 
204 aa  228  5e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0096  heat shock protein GrpE  77.46 
 
 
190 aa  212  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  50 
 
 
190 aa  142  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  48.5 
 
 
192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  47.86 
 
 
198 aa  129  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  40 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  40 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  40 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  40 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  40 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  40 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  40 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.91 
 
 
189 aa  112  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  40.96 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  40.96 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  39.46 
 
 
188 aa  111  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  43.23 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  44.53 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 
210 aa  108  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  39.66 
 
 
192 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  43.88 
 
 
213 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  41.5 
 
 
198 aa  101  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  40.82 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  35.79 
 
 
186 aa  97.8  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  40.46 
 
 
208 aa  97.1  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  39.69 
 
 
208 aa  96.3  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  32.65 
 
 
208 aa  95.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.59 
 
 
217 aa  93.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  36.65 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  38.31 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  36.63 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  37.93 
 
 
231 aa  92  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  34.86 
 
 
178 aa  92  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 
206 aa  91.7  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  38.25 
 
 
181 aa  92  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  37.16 
 
 
181 aa  91.7  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  33.9 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.68 
 
 
213 aa  90.5  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  41.43 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1643  GrpE protein  35.64 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120336  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  33.88 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  33.14 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  33.14 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  33.14 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  33.14 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  39.69 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  39.69 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  39.69 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  39.69 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  39.69 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  39.69 
 
 
178 aa  89.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  39.69 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  39.69 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  30.77 
 
 
179 aa  89  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  32.14 
 
 
207 aa  89  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  36.53 
 
 
210 aa  88.6  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  31.44 
 
 
204 aa  88.6  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  37.82 
 
 
245 aa  88.6  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  39.55 
 
 
192 aa  88.6  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  41.61 
 
 
200 aa  88.2  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  35.58 
 
 
178 aa  88.2  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  35.58 
 
 
178 aa  88.2  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  31.98 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  36.03 
 
 
203 aa  88.2  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  36.09 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  34.43 
 
 
176 aa  87.8  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  36.09 
 
 
203 aa  87.8  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  36.84 
 
 
173 aa  87  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  34.43 
 
 
176 aa  87  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  31.55 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  32.8 
 
 
200 aa  86.3  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2133  HSP70 family protein GrpE  39.06 
 
 
199 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0603928  normal  0.40294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  34.01 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 
202 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  36.88 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  34.15 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 
199 aa  85.9  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  36.72 
 
 
244 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  34.59 
 
 
230 aa  85.5  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  34.66 
 
 
184 aa  85.9  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  36.07 
 
 
186 aa  85.9  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  34.59 
 
 
230 aa  85.9  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  38.51 
 
 
185 aa  85.1  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  36.03 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2457  GrpE protein  39.84 
 
 
204 aa  85.1  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.23302  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  34.69 
 
 
179 aa  85.1  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  35.8 
 
 
189 aa  85.5  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 
189 aa  85.1  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0212  co-chaperone GrpE  37.14 
 
 
187 aa  85.1  6e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0867096  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
215 aa  84.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  30.93 
 
 
201 aa  84.7  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  37.84 
 
 
192 aa  84.7  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  38.06 
 
 
198 aa  84.3  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  34.93 
 
 
193 aa  84.7  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  34.71 
 
 
217 aa  84.3  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>