24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08680 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08680  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 248 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.738223 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14680  hypothetical protein  63.79 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0769  hypothetical protein  39.01 
 
 		 439 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1371  Peptidoglycan-binding LysM  56.9 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1756  hypothetical protein  49.38 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.763596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5836  hypothetical protein  50 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425484  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2323  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  56.9 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121669  hitchhiker  0.0000988538 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20580  LysM domain-containing protein  46.43 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2704  hypothetical protein  42.86 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00973242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2435  hypothetical protein  50.85 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0124023 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2503  hypothetical protein  50.82 
 
 		 292 aa  52.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1254  hypothetical protein  48.28 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  43.37 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3805  hypothetical protein  48.44 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179227  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  35.37 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  39.74 
 
 		 389 aa  46.2  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  37.97 
 
 		 1079 aa  45.4  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4246  Peptidoglycan-binding LysM  34.15 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  44.26 
 
 		 1051 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  42.86 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4275  hypothetical protein  36.19 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  38.98 
 
 		 339 aa  42.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  34.15 
 
 		 219 aa  42  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1820  hypothetical protein  36.21 
 
 		 295 aa  42  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>