27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01160 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  846    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  67.85 
 
 
407 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  64.58 
 
 
412 aa  529  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  63.43 
 
 
412 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  61.63 
 
 
397 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  61.59 
 
 
393 aa  510  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  62.44 
 
 
391 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  58.93 
 
 
400 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  37.24 
 
 
397 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  36.66 
 
 
396 aa  253  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  37.03 
 
 
395 aa  239  9e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  34.19 
 
 
396 aa  210  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  30 
 
 
461 aa  179  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4863  hypothetical protein  36.8 
 
 
204 aa  136  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2291  hypothetical protein  30.77 
 
 
449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  34.65 
 
 
199 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  24.94 
 
 
368 aa  89.4  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  25.18 
 
 
412 aa  87.4  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  26.8 
 
 
457 aa  84.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  26.57 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02770  ATPase  25.88 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25650  hypothetical protein  25.34 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  25.29 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  25.98 
 
 
416 aa  57.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0503  hypothetical protein  23.6 
 
 
362 aa  57  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.67 
 
 
1668 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2550  hypothetical protein  25 
 
 
357 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.358793  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>