48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2494 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
231 aa  464  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4007  GCN5-related N-acetyltransferase  48.2 
 
 
227 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0945133  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3786  FR47 domain protein  46.15 
 
 
224 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00741152  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5486  FR47 domain-containing protein  45.09 
 
 
242 aa  175  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359302  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  46.03 
 
 
241 aa  168  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3797  FR47 domain protein  42.54 
 
 
244 aa  165  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  44.5 
 
 
213 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1546  GCN5-related N-acetyltransferase  45.74 
 
 
266 aa  164  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138992  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2990  GCN5-related N-acetyltransferase  42.34 
 
 
229 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2053  FR47 domain protein  44.39 
 
 
240 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6287  GCN5-related N-acetyltransferase  38.74 
 
 
239 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30200  predicted acyltransferase  38.74 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.641139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5553  GCN5-related N-acetyltransferase  35.04 
 
 
232 aa  128  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6749  GCN5-related N-acetyltransferase  37.79 
 
 
242 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1672  GCN5-related N-acetyltransferase  40.44 
 
 
238 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1699  FR47 domain-containing protein  40.18 
 
 
238 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1220  FR47-like  40.18 
 
 
238 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1609  FR47 domain-containing protein  38.77 
 
 
247 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  40.53 
 
 
247 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  38.68 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537027  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1737  GCN5-related N-acetyltransferase  40.89 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00558644  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2433  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000357302  normal  0.518227 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3737  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 
228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4874  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
238 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.508212  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
261 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1951  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
227 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0679  putative acetyltransferase  35.75 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0547  GCN5-related N-acetyltransferase  44.83 
 
 
228 aa  92.4  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1078  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2418  GCN5-related N-acetyltransferase  39.77 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4440  hypothetical protein  33.02 
 
 
256 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00246211  decreased coverage  0.000186457 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1948  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
285 aa  46.2  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3838  GCN5-related N-acetyltransferase  31.15 
 
 
269 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113052 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.35 
 
 
147 aa  45.4  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1457  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
283 aa  45.4  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.715432  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115706  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2252  acetyltransferase  37.1 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000131288  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6861  hypothetical protein  41.38 
 
 
188 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574097  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0638  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.71 
 
 
154 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1575  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  33.33 
 
 
311 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0338041 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1651  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
278 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.226179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  45.61 
 
 
153 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1798  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.42 
 
 
156 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  28.69 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1402  GNAT family acetyltransferase  31.71 
 
 
278 aa  42.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346646  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2840  GCN5-related N-acetyltransferase  36.07 
 
 
157 aa  42.4  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000815597  normal  0.0271739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
250 aa  41.6  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0181113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.75 
 
 
151 aa  41.6  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>