27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0215 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0215  conserved hypothetical protein; putative adenylate cyclase domain  100 
 
 
523 aa  988    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  hitchhiker  0.00638587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  35.34 
 
 
510 aa  199  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  32.76 
 
 
495 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  33.59 
 
 
492 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  31.08 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  31.41 
 
 
527 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  29.74 
 
 
544 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  31.99 
 
 
512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  30.83 
 
 
522 aa  124  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  28.77 
 
 
539 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  30.18 
 
 
496 aa  121  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  29.05 
 
 
505 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5198  CHAD domain containing protein  29.64 
 
 
526 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  36.56 
 
 
598 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  31.31 
 
 
490 aa  110  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  29.38 
 
 
519 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  31.34 
 
 
502 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  31.34 
 
 
502 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  31.34 
 
 
502 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  28.41 
 
 
517 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  27.01 
 
 
513 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2900  CHAD domain-containing protein  26.85 
 
 
509 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6944  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  33.33 
 
 
272 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  31.61 
 
 
329 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  30.23 
 
 
310 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  27.5 
 
 
520 aa  45.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  24.53 
 
 
508 aa  43.5  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>