21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0337 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0337  prenyltransferase  100 
 
 		 286 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12800  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  55.28 
 
 		 318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04400  prenyltransferase  56.07 
 
 		 294 aa  280  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13800  prenyltransferase  53.5 
 
 		 294 aa  278  5e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0993725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3488  prenyltransferase  50.17 
 
 		 300 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2888  UbiA prenyltransferase  51.56 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0837805 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21210  prenyltransferase  48.75 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2205  prenyltransferase  35.41 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  34.23 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2047  UbiA prenyltransferase  31.5 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1002  UbiA prenyltransferase  32.61 
 
 		 340 aa  93.6  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  33.5 
 
 		 296 aa  85.5  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  34.29 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  33.17 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0848  prenyltransferase  30.97 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0221544  normal  0.0909902 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0118  prenyltransferase  31.16 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1782  UbiA prenyltransferase  26.88 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  23.27 
 
 		 283 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2249  UbiA prenyltransferase  25.98 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.36 
 
 		 315 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0232  prenyltransferase  28.3 
 
 		 289 aa  42.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>