32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0333 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  100 
 
 
538 aa  1092    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  43.78 
 
 
371 aa  147  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06780  hypothetical protein  32.48 
 
 
412 aa  140  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  30.44 
 
 
445 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  42.86 
 
 
402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  37.44 
 
 
313 aa  124  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  29.53 
 
 
411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  38.36 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  40.61 
 
 
432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1197  hypothetical protein  36.18 
 
 
386 aa  110  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.673489  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  39.91 
 
 
382 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  36.03 
 
 
434 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  37.55 
 
 
450 aa  104  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  37.11 
 
 
450 aa  103  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  33.97 
 
 
434 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3325  hypothetical protein  38.35 
 
 
402 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0514676  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  35.48 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  38.79 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07140  predicted membrane protein  38.03 
 
 
423 aa  79.3  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125251  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  34.75 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  33.49 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  32.84 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  30.15 
 
 
362 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  29.34 
 
 
374 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18000  hypothetical protein  28.34 
 
 
405 aa  62  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.514365  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1720  transport protein  31.25 
 
 
344 aa  60.1  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  33.33 
 
 
427 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  26.34 
 
 
361 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2187  hypothetical protein  28.43 
 
 
361 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  26.24 
 
 
254 aa  47  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  29.63 
 
 
245 aa  44.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0858  hypothetical protein  37.5 
 
 
394 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.122318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>