More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2221 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  68.14 
 
 
518 aa  719    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1867  GMP synthase  82.18 
 
 
518 aa  885    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  67.11 
 
 
520 aa  726    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  61.75 
 
 
541 aa  664    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  67.11 
 
 
520 aa  715    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  69.79 
 
 
521 aa  738    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1635  GMP synthase  81.61 
 
 
518 aa  879    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.90601  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0378  GMP synthase, large subunit  66.79 
 
 
534 aa  694    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246609 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  66.73 
 
 
520 aa  720    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  66.6 
 
 
526 aa  703    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  66.86 
 
 
535 aa  713    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  64.07 
 
 
518 aa  691    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0005  GMP synthase  81.61 
 
 
518 aa  880    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  64.75 
 
 
528 aa  677    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  66.35 
 
 
520 aa  722    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  69.02 
 
 
518 aa  720    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  66.92 
 
 
520 aa  713    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  64.08 
 
 
525 aa  686    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  69.98 
 
 
521 aa  742    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2895  GMP synthase, large subunit  65.09 
 
 
533 aa  688    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.131714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  65.06 
 
 
540 aa  696    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  64.04 
 
 
540 aa  683    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  64.49 
 
 
530 aa  694    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2221  GMP synthase  100 
 
 
535 aa  1095    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333577  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  67.88 
 
 
520 aa  728    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  66.92 
 
 
535 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  67.5 
 
 
556 aa  709    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  67.11 
 
 
524 aa  706    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  64.17 
 
 
540 aa  703    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  67.11 
 
 
523 aa  716    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1375  GMP synthase  85 
 
 
520 aa  911    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497878  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  62.85 
 
 
537 aa  675    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  69.98 
 
 
521 aa  740    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1587  GMP synthase  82.31 
 
 
520 aa  881    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0923509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  66.48 
 
 
519 aa  706    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  66.92 
 
 
534 aa  716    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  64.62 
 
 
520 aa  678    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  67.69 
 
 
565 aa  717    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  69.6 
 
 
518 aa  730    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  65.71 
 
 
519 aa  697    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3696  GMP synthase  76.91 
 
 
519 aa  838    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383479  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  56.81 
 
 
516 aa  595  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  56.81 
 
 
516 aa  595  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  56.43 
 
 
517 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  56.24 
 
 
516 aa  592  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  56.7 
 
 
520 aa  590  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  57.58 
 
 
514 aa  585  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  57.58 
 
 
514 aa  585  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  56.32 
 
 
520 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  55.99 
 
 
527 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  55.91 
 
 
527 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  55.72 
 
 
527 aa  581  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  57.14 
 
 
518 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  56.05 
 
 
518 aa  581  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3367  GMP synthase  55.29 
 
 
541 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0290  GMP synthase  55.79 
 
 
524 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  56.32 
 
 
520 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1622  GMP synthase  55.74 
 
 
534 aa  569  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661733  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  55.84 
 
 
532 aa  571  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  53.8 
 
 
522 aa  568  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  58.1 
 
 
525 aa  569  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  54.08 
 
 
525 aa  565  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  55.73 
 
 
533 aa  566  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  53.89 
 
 
525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  53.89 
 
 
525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  54.41 
 
 
513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  53.89 
 
 
525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  53.7 
 
 
525 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  53.89 
 
 
525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  53.89 
 
 
525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  53.89 
 
 
525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  54.08 
 
 
525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  53.51 
 
 
525 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  52.22 
 
 
514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3013  GMP synthase  55.15 
 
 
540 aa  564  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  54.14 
 
 
526 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  54.08 
 
 
525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  54.75 
 
 
521 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1287  GMP synthase  54.13 
 
 
539 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0197854  normal  0.456639 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.55 
 
 
517 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  54.41 
 
 
520 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  54.08 
 
 
525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  53.89 
 
 
525 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  53.89 
 
 
525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  53.7 
 
 
525 aa  559  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2547  GMP synthase  54.78 
 
 
538 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72593  hitchhiker  0.00733595 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  52.75 
 
 
525 aa  560  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  54.46 
 
 
525 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2337  GMP synthase  53.66 
 
 
544 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1422  GMP synthase  54.93 
 
 
535 aa  560  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  53.89 
 
 
525 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  56.95 
 
 
518 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  52.65 
 
 
525 aa  558  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1261  GMP synthase  54.78 
 
 
538 aa  559  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  52.78 
 
 
517 aa  560  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  53.55 
 
 
517 aa  561  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  52.18 
 
 
525 aa  558  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  52.56 
 
 
525 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  52.56 
 
 
525 aa  558  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  53.61 
 
 
520 aa  556  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>