28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0941 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1107  TraG-like protein  87.33 
 
 
529 aa  936    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0941  Cju26  100 
 
 
922 aa  1892    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247949  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0952  hypothetical protein  88.65 
 
 
371 aa  687    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.135953  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0805  hypothetical protein  28.93 
 
 
1093 aa  191  5e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199281  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0950  hypothetical protein  58.9 
 
 
174 aa  158  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.388203  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0951  hypothetical protein  76.92 
 
 
40 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.621371  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2169  TraG-like  22.81 
 
 
900 aa  69.3  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0014  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  22.79 
 
 
940 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5383  TraG domain-containing protein  22.63 
 
 
938 aa  60.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00832018  normal  0.693135 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4304  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  23.91 
 
 
1051 aa  58.9  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4513  TraG domain protein  21.75 
 
 
942 aa  58.9  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4427  TraG domain protein  21.35 
 
 
937 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364582  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4432  TraG domain-containing protein  21.51 
 
 
936 aa  57.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1524  TraG domain-containing protein  29.49 
 
 
923 aa  57  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630102  normal  0.653748 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6815  TraG domain-containing protein  21.47 
 
 
1313 aa  57  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2664  hypothetical protein  29.47 
 
 
924 aa  56.6  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4618  TraG domain-containing protein  21.75 
 
 
939 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2331  hypothetical protein  29.47 
 
 
923 aa  56.6  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4526  TraG domain-containing protein  20.98 
 
 
937 aa  55.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.769424 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4388  TraG domain protein  20.98 
 
 
937 aa  55.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.812374 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0037  hypothetical protein  20.75 
 
 
919 aa  55.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1108  hypothetical protein  96 
 
 
53 aa  55.1  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.253412  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_18  conjugative transfer protein TraG  23.17 
 
 
931 aa  49.7  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  19.95 
 
 
1136 aa  48.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0243  hypothetical protein  21.93 
 
 
1199 aa  47.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0003  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  20.74 
 
 
960 aa  47.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0305  hypothetical protein  22.92 
 
 
1205 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4167  TraG domain-containing protein  28.46 
 
 
1015 aa  45.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.554072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>