More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2071 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2322  glutamyl-tRNA synthetase  69.7 
 
 		 590 aa  795    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2071  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 582 aa  1178    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0445  glutamyl-tRNA synthetase  69.13 
 
 		 573 aa  825    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2609  glutamyl-tRNA synthetase  72.11 
 
 		 579 aa  853    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2537  glutamyl-tRNA synthetase  69.13 
 
 		 574 aa  806    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1470  glutamyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 571 aa  442  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000234189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2335  glutamyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 569 aa  434  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000111665  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1466  glutamyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 564 aa  426  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0747  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 560 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2885  glutamyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 561 aa  389  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1817  glutamyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 561 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.183572  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2371  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 562 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1110  glutamyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0091  glutamyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 		 557 aa  341  2e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0583  glutamyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 		 555 aa  341  2e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153403  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0338  glutamyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 555 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1648  glutamyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 555 aa  337  5e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0253  glutamyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 		 555 aa  336  7.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.672703  normal  0.642946 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1069  glutamyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 574 aa  324  3e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0462045  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2208  glutamyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 634 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387382  normal  0.932733 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1338  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 570 aa  311  2e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162859  normal  0.450073 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0371  glutamyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 570 aa  310  5e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1411 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1533  glutamyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 588 aa  309  8e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.403992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1756  glutamyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 570 aa  307  3e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1137  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 570 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.215502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0816  glutamyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 569 aa  296  9e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2131  glutamyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 566 aa  293  5e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000159948  hitchhiker  0.0000949008 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0311  glutamyl-tRNA synthetase  29.97 
 
 		 569 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.396423 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72287  glutaminyl-tRNA synthetase  29.07 
 
 		 799 aa  192  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579144  normal  0.826623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 556 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 556 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 556 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2413  glutaminyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000218793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 556 aa  181  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 580 aa  179  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 		 555 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 556 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 563 aa  177  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 555 aa  177  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 552 aa  177  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 		 554 aa  177  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 566 aa  176  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 554 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 554 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 554 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 555 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 555 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  27.22 
 
 		 554 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 554 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 554 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 555 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 555 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 		 555 aa  173  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 		 568 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2689  glutaminyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 556 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 		 552 aa  173  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3240  glutaminyl-tRNA synthetase  28.15 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00746606  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03410  glutaminyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 		 556 aa  173  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 		 556 aa  172  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 		 557 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 		 559 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 555 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 555 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 555 aa  171  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 		 569 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09157  Glutaminyl-tRNA synthetase (Eurofung)  30.36 
 
 		 628 aa  171  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 565 aa  170  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 590 aa  170  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  27.79 
 
 		 582 aa  169  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 		 582 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 		 558 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 		 552 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 569 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 		 556 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 573 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 569 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 		 556 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 		 552 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 569 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  27 
 
 		 540 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 569 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 		 587 aa  167  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2188  glutaminyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 816 aa  167  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00249648  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 		 556 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 		 569 aa  167  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 565 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 		 569 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23867  predicted protein  29.76 
 
 		 541 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 552 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  26.35 
 
 		 556 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 589 aa  166  9e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  26.54 
 
 		 571 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 		 569 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>