18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1736 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1736  integrase family protein  100 
 
 
417 aa  860    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0046  integrase family protein  54.05 
 
 
417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1605  integrase family protein  41.41 
 
 
453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0820528  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2798  phage integrase  44.19 
 
 
312 aa  254  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2320  phage integrase  31.63 
 
 
379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.971576  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1324  integrase family protein  31.91 
 
 
423 aa  126  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000102488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2299  phage integrase  26.07 
 
 
342 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0506  phage integrase family protein  25.82 
 
 
424 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1002  phage integrase  26.91 
 
 
408 aa  87  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.606138  decreased coverage  0.00492215 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1399  integrase family protein  24.78 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.433904  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3611  integrase domain protein SAM domain protein  29.69 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00442535  normal  0.0137307 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  25.24 
 
 
309 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 
313 aa  49.7  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  31.16 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  31.16 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  27.01 
 
 
291 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  26.34 
 
 
285 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  25.62 
 
 
291 aa  43.1  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.173073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>