28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1324 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1324  integrase family protein  100 
 
 		 423 aa  883    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000102488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2320  phage integrase  32.25 
 
 		 379 aa  169  7e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.971576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1736  integrase family protein  31.91 
 
 		 417 aa  127  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2299  phage integrase  26.4 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0046  integrase family protein  30.71 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1605  integrase family protein  28.61 
 
 		 453 aa  106  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0820528  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1002  phage integrase  27.34 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.606138  decreased coverage  0.00492215 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2798  phage integrase  27.78 
 
 		 312 aa  69.7  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0506  phage integrase family protein  24.76 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1399  integrase family protein  23.56 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.433904  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  30.81 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  31.21 
 
 		 291 aa  57  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  30.95 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0866  phage integrase  27.88 
 
 		 139 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.201994  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  25.42 
 
 		 284 aa  50.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2063  tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 290 aa  50.1  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  25.89 
 
 		 373 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1777  tyrosine recombinase XerD  26.37 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  26.37 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  27.8 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0603  hypothetical protein  25.76 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5285  phage integrase family protein  27.94 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  26.82 
 
 		 309 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  33.78 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  27.98 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.96 
 
 		 298 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3195  hypothetical protein  31.97 
 
 		 156 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  25.95 
 
 		 315 aa  43.1  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>