14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0046 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0046  integrase family protein  100 
 
 
417 aa  859    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1736  integrase family protein  54.05 
 
 
417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1605  integrase family protein  37.89 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0820528  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2798  phage integrase  38.98 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2320  phage integrase  29.34 
 
 
379 aa  119  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.971576  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1324  integrase family protein  30.88 
 
 
423 aa  110  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000102488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2299  phage integrase  24.24 
 
 
342 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0506  phage integrase family protein  22.45 
 
 
424 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1399  integrase family protein  25.09 
 
 
430 aa  69.7  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.433904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1002  phage integrase  21.02 
 
 
408 aa  54.3  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.606138  decreased coverage  0.00492215 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  26.67 
 
 
295 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4492  integrase family protein  30.71 
 
 
422 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.97 
 
 
313 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1624  phage integrase family protein  23.91 
 
 
235 aa  43.1  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>