More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0506 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0506  phage integrase family protein  100 
 
 		 424 aa  887    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1002  phage integrase  36.87 
 
 		 408 aa  265  8e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.606138  decreased coverage  0.00492215 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2320  phage integrase  31.73 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.971576  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2299  phage integrase  29.59 
 
 		 342 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3195  hypothetical protein  38.03 
 
 		 156 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1736  integrase family protein  25.82 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1271  integrase family protein  33.1 
 
 		 180 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0155306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1399  integrase family protein  28.69 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.433904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  33.63 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  31.09 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  32.14 
 
 		 295 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  29.1 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  29.1 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  29.1 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  29.1 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  29.1 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  29.1 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  29.1 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  33.53 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  26.15 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  29.02 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  27.64 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.31 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  32.77 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  30.7 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0866  phage integrase  32.85 
 
 		 139 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.201994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1605  integrase family protein  24.46 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0820528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  27.1 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  26.77 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 299 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  25.86 
 
 		 289 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  30.77 
 
 		 308 aa  72  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  28.7 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  28.05 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  25 
 
 		 291 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  25.98 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0046  integrase family protein  22.45 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  27.67 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  28.06 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  28.57 
 
 		 299 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  28.27 
 
 		 364 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.4 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  28.27 
 
 		 364 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  26.58 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0409  Phage integrase  29.13 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383536  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.94 
 
 		 295 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  30.46 
 
 		 332 aa  69.7  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  28.27 
 
 		 344 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  25.83 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  27.35 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  26.97 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  28.51 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  28.05 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  25.29 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  29.78 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  30.64 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  29.18 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  27.52 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  27.37 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1324  integrase family protein  24.76 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000102488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  29.06 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  24.9 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  30.86 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  25.13 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  28 
 
 		 299 aa  67  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  30.26 
 
 		 319 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  25.13 
 
 		 312 aa  67  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  26.7 
 
 		 302 aa  67  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.64 
 
 		 313 aa  67  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.35 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  25.9 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  32.94 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  30.43 
 
 		 290 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  25.87 
 
 		 253 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  24.9 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  26.23 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.81 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.81 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.81 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.81 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.81 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.81 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.81 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  28.4 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.81 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  25.88 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  25.21 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  25.49 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.77 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  27.35 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.81 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  24.23 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.5 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.91 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  27 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.22 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>