211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2299 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2299  phage integrase  100 
 
 		 342 aa  720    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2320  phage integrase  29.89 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.971576  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0506  phage integrase family protein  29.59 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1324  integrase family protein  26.4 
 
 		 423 aa  120  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000102488 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1399  integrase family protein  27.74 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.433904  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1736  integrase family protein  26.07 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1002  phage integrase  28.29 
 
 		 408 aa  99.4  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.606138  decreased coverage  0.00492215 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1605  integrase family protein  26.47 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0820528  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0046  integrase family protein  24.24 
 
 		 417 aa  85.9  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0228  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  55.7 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0665  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  55.7 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.180609  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0517  hypothetical protein  35.59 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2798  phage integrase  28.24 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1515  integrase family protein  25.39 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.64 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  26.46 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  26.02 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.32 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  24.67 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3569  phage integrase family protein  24.66 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0892176 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  22.77 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  22.77 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  22.77 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  22.77 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  22.77 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  22.77 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  22.77 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3501  integrase family protein  25.75 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  24.12 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  27.5 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  27.5 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  27.5 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5285  phage integrase family protein  26.24 
 
 		 388 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.96 
 
 		 298 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2987  putative site specific integrase  25.37 
 
 		 318 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  22.87 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  24.44 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  25.13 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  22.83 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  21.62 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1271  integrase family protein  25.66 
 
 		 180 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0155306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  23.02 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  25.13 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  22.73 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  23.81 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  24.75 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  24.19 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  24.75 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  24.75 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  26.15 
 
 		 254 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  23.28 
 
 		 307 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0142  Phage integrase  27.54 
 
 		 343 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  25 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  23.58 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  22.27 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  24.87 
 
 		 295 aa  53.5  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  22.81 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  23.5 
 
 		 301 aa  53.5  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  25.9 
 
 		 290 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.94 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  22.05 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  24.38 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.94 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.94 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  21.51 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  24.47 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0189  Phage integrase  28 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  23.56 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.7 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  23.77 
 
 		 302 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.54 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  23.53 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  26.11 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  22.73 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  22.77 
 
 		 290 aa  51.2  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  23.01 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0872  phage integrase family protein  23.47 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  22.91 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.83 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  23.71 
 
 		 295 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.83 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  21.4 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.19 
 
 		 296 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  20.53 
 
 		 304 aa  49.7  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3697  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.53 
 
 		 328 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  20.61 
 
 		 299 aa  49.3  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0214  site-specific recombinase XerD  21.5 
 
 		 277 aa  49.3  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  25.93 
 
 		 332 aa  49.3  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.02 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.02 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.02 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.02 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  22.59 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.02 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  23.64 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  23.93 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  20.78 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2972  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>