12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2798 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2798  phage integrase  100 
 
 		 312 aa  647    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1736  integrase family protein  44.19 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0046  integrase family protein  38.98 
 
 		 417 aa  214  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1605  integrase family protein  30.84 
 
 		 453 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0820528  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2320  phage integrase  33.59 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.971576  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2299  phage integrase  28.24 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1324  integrase family protein  27.78 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000102488 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2651  integrase/recombinase  27.56 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.178628 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  19.75 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1002  phage integrase  25.19 
 
 		 408 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.606138  decreased coverage  0.00492215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  24.84 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  26.88 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.173073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>